ג'וניור הובלות מספקת שירותי אחסנה לטווח ארוך במחסנים חדשים, סגורים ומאובטחים. המחסנים מתאימים לאחסנת תכולת דירות, ציוד יקר ועתיק, ציוד היי-טק ועוד. המקום מאובטח באמצעות מצלמות ומוקד אבטחה 24 שעות ביממה, 7 ימים בשבוע.
כל לקוח המבקש לאחסן את תכולתו במחסנים, מתבקש למספר את הקרטונים שלו ולציין בחוזה האחסנה את פירוט התכולה, על מנת שיהיה רישום מדויק ובטוח שימנע טעויות ואי נעימויות.
כל לקוח מקבל תא סגור לאחסון תכולתו, ואת המפתח לתא מקבל ביום האחסנה. ניתן להגיע למקום במשך כל תקופת האחסנה.
ג'וניור הובלות בחיפה והובלות חיפה מקפידה על ניקיון המחסנים ואוורורם, ודואגת להדברה שהינה ידידותית לסביבה ולחפצים יקרי ערך. במחסנים ישנו ציוד כיבוי האש חדיש ביותר, למיגון מקסימלי.